Fasilitas di Klinik paru yang dimiliki RSUD Tarakan Jakarta meliputi : Konsultasi asma dan penyakit paru obstruktif kronik, Terapi Inhalasi Penyakit tuberculosis, infeksi paru dan pernapasan, Pemeriksaan faal paru, Konsultasi gangguan tidur, Konsultasi berhenti merokok. Dilengkapi dengan alat diagnosa, Spirometri, Bronkoskopi dan penanganan lebih lanjut oleh para dokter ahli. Penyakit yang biasa di tangani di klinik ini diantaranya :

• Pemeriksaan rutin paru
• Pemeriksaan thorax
• Pemasangan WSD
• Spirometri
• Nebulizer
• Pungsi pleura
• DOT'S