RSUD Tarakan memiliki tenaga perawat dan bidan yang terlatih serta Dokter ahli spesialis kandungan dan kebidanan, untuk membantu para Ibu yang ingin konsultasi seputar masalah kandungan dan kebidanan. 

RSUD Tarakan merupakan RS Sayang Ibu dan Anak yang memiliki klinik kebidanan (obstetri) memberikan layanan perihal kehamilan: seperti program hamil, pemeriksaan kehamilan rutin (ante natal care atau pre natal care) dan pencegahan kehamilan (kontrasepsi). Klinik kebidanan (ginekologi) memberikan layanan perihal masalah kesehatan organ reproduksi wanita atau berbagai perihal keluhan kewanitaan. 

Pada masa sebelum persalinan, ibu juga didampingi bidan dan dapat berkonsultasi dengan Dokter Spesialis Kandungan & Kebidanan untuk pembekalan pengetahuan dan persiapan kehamilan dan persalinan. Selain itu RSUD Tarakasn juga menyediakan konsultasi laktasi untuk mengetahui bagaimana cara mempersiapkan dan memberikan ASI yang baik dan benar oleh Dokter Spesialis Kandungan & kebidanan.