Di RSUD Tarakan terdapat satu klinik yang khusus menangani masalah seputar urologi, keluhan-keluhan mengenai saluran kencing dan lainnya yang berhubungan dengan urologi dapat diatasi dan dibantu di klinik tersebut, ditangani dokter-dokter ahli dan dengan bantuan peralatan yang memadai.

Penyakit yang biasa di tangani di klinik ini diantaranya :

• Uruflowmetri
• Bedah rawat jalan
• Disfungsi ereksi
• Operasi dengan open & endo Surgery Untuk kasus Urology